A Diretoria Administrativa é responsável por planejar, coordenar e orientar as atividades relacionadas às áreas administrativa, financeira e de gestão de pessoas; coordenar a aplicação de normas internas, portarias, gestão de contratos e serviços de licitações, fiscalização de contratos, convênios, coordenar o plano de aquisições, o sistema de material e a logística, além de coordenar a execução orçamentária, contábil e financeira do IPLAN.

A Diretoria de Planejamento Urbano é responsável por coordenar a elaboração, a revisão e a atualização da legislação urbanística municipal, promover a integração entre os instrumentos de planejamento municipal e suas atualizações, realizar a análise de Estudos de Impacto de Vizinhança (EIV) e definir diretrizes para projetos de parcelamento do solo e projetos de grande impacto.

A Diretoria de Informações é responsável por identificar e propor soluções estratégicas de aplicação de tecnologia da informação e comunicação de dados para dar suporte às atividades do Instituto, coordenar a implantação e gerir o Sistema de Informações Geográficas de Santa Maria; propor a política de geoprocessamento da gestão municipal; prestar consultoria técnica a outros órgãos e entidades da administração pública, bem como fornecer informações à sociedade.

A Diretoria de Desenvolvimento Integrado é responsável por gerenciar, prospectar e fomentar iniciativas e projetos estratégicos, de impacto e relevância para o planejamento urbano de Santa Maria, elaborar e atualizar o Caderno de Encargos, além de articular e assessorar na elaboração de projetos especiais para o Município.